Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TgfaP48030 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TgfaP48030 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms