Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SrprbP47758 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms