Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capza1P47753 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capza1P47753 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms