Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sipa1P46062 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sipa1P46062 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms