Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ItgavP43406 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms