Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clec3bP43025 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms