Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx1-2P42580 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx1-2P42580 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx1-2P42580 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms