Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tac1P41539 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tac1P41539 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms