Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl28P41105 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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