Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox7P40646 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox7P40646 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms