Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TfamP40630 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TfamP40630 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TfamP40630 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TfamP40630 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TfamP40630 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TfamP40630 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TfamP40630 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TfamP40630 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TfamP40630 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TfamP40630 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms