Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FynP39688 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FynP39688 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FynP39688 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FynP39688 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FynP39688 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FynP39688 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FynP39688 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FynP39688 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FynP39688 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FynP39688 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms