Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tjp1P39447 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tjp1P39447 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms