Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col18a1P39061 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Col18a1P39061 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col18a1P39061 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms