Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdh4P39038 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdh4P39038 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdh4P39038 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdh4P39038 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdh4P39038 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdh4P39038 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh4P39038 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms