Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtlP38585 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtlP38585 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtlP38585 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtlP38585 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtlP38585 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtlP38585 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtlP38585 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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