Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk2P38575 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk2P38575 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk2P38575 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms