Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PpargP37238 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PpargP37238 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpargP37238 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpargP37238 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpargP37238 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpargP37238 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpargP37238 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PpargP37238 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PpargP37238 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PpargP37238 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms