Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sar1aP36536 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms