Protein–RNA interactions for Protein: P35761

Ttk, Dual specificity protein kinase TTK, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtkP35761 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtkP35761 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtkP35761 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtkP35761 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TtkP35761 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TtkP35761 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TtkP35761 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TtkP35761 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TtkP35761 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TtkP35761 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms