Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms