Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mmp12P34960 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms