Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc1P34928 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoc1P34928 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms