Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms