Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsx2P31316 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms