Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc11P31313 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc11P31313 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms