Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd28P31041 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd28P31041 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd28P31041 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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