Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VtnP29788 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VtnP29788 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VtnP29788 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VtnP29788 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms