Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HexaP29416 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HexaP29416 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HexaP29416 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HexaP29416 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HexaP29416 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HexaP29416 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HexaP29416 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HexaP29416 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HexaP29416 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HexaP29416 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HexaP29416 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HexaP29416 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HexaP29416 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HexaP29416 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HexaP29416 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms