Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprmP28828 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprmP28828 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprmP28828 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprmP28828 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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