Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif5cP28738 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif5cP28738 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms