Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Celf1P28659 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Celf1P28659 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Celf1P28659 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms