Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd9P28357 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms