Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja4P28235 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gja4P28235 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms