Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-DMaP28078 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-DMaP28078 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-DMaP28078 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms