Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnd1P25322 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccnd1P25322 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms