Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms