Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd11P23813 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd11P23813 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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