Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZfaP23607 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZfaP23607 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZfaP23607 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZfaP23607 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZfaP23607 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms