Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clk1P22518 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clk1P22518 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clk1P22518 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms