Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou3f1P21952 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms