Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SftpcP21841 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms