Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcer1aP20489 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fcer1aP20489 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms