Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms