Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdgfaP20033 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdgfaP20033 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms