Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NelfeP19426 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NelfeP19426 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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NelfeP19426 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NelfeP19426 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NelfeP19426 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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NelfeP19426 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NelfeP19426 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms