Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnc1P19123 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms