Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps6ka1P18653 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka1P18653 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms