Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18532 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18532 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18532 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18532 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18532 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18532 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18532 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P18532 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18532 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P18532 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms