Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P18526 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P18526 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P18526 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P18526 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P18526 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P18526 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms